MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017814	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017814	TAAA	2	8	32	39	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017814	T	6	6	40	45	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017814	CTT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017814	TAA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017814	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017814	TAA	2	6	111	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017814	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017814	TTTA	2	8	127	134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017814	T	7	7	143	149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017814	T	7	7	165	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017814	ATT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017814	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017814	AG	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017814	A	6	6	291	296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017814	TA	3	6	344	349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017814	GTTT	2	8	350	357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017814	AC	3	6	375	380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017814	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017814	TTA	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017814	AAAT	2	8	469	476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017814	T	7	7	501	507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017814	AGT	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017814	AAG	2	6	548	553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017814	A	7	7	561	567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017814	ACAAA	2	10	587	596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017814	TTATT	2	10	648	657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017814	ATT	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858830
29	NC_017814	CAT	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858830
30	NC_017814	CTT	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
31	NC_017814	CTT	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
32	NC_017814	AGCATT	2	12	854	865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858830
33	NC_017814	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858830
34	NC_017814	CTG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017814	TCA	3	9	1026	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017814	CCA	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017814	TTATC	2	10	1056	1065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017814	TAA	2	6	1078	1083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017814	TTTA	2	8	1084	1091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017814	CT	3	6	1097	1102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017814	T	7	7	1168	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017814	TTTG	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017814	TC	3	6	1212	1217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017814	ATA	2	6	1264	1269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017814	A	6	6	1300	1305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017814	C	7	7	1406	1412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017814	TAA	2	6	1441	1446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017814	TAA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017814	TA	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017814	TTA	2	6	1527	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017814	TAT	2	6	1538	1543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017814	ATA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017814	TTTATA	2	12	1577	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017814	ATT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017814	T	6	6	1617	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017814	TA	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017814	TAT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017814	TTTG	2	8	1727	1734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017814	CTTTA	2	10	1795	1804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017814	TAT	3	9	1817	1825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017814	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017814	TAT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017814	TAT	2	6	1844	1849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017814	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858831
65	NC_017814	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858831
66	NC_017814	TC	3	6	2082	2087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017814	CCT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017814	TCT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017814	TTAT	2	8	2139	2146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017814	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017814	A	7	7	2160	2166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017814	AAC	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017814	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017814	CA	3	6	2203	2208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017814	A	7	7	2223	2229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017814	CT	3	6	2243	2248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017814	CTAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017814	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017814	CTG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
80	NC_017814	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
81	NC_017814	TCT	2	6	2369	2374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
82	NC_017814	CTA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
83	NC_017814	ATTT	2	8	2402	2409	25 %	75 %	0 %	0 %	386858832
84	NC_017814	CTT	2	6	2435	2440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
85	NC_017814	C	6	6	2442	2447	0 %	0 %	0 %	100 %	386858832
86	NC_017814	CTG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
87	NC_017814	CCT	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858832
88	NC_017814	CTG	3	9	2525	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
89	NC_017814	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
90	NC_017814	GTT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
91	NC_017814	CAC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858832
92	NC_017814	GCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858832
93	NC_017814	TGT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
94	NC_017814	TGC	3	9	2691	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
95	NC_017814	CTG	4	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
96	NC_017814	TTA	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
97	NC_017814	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858832
98	NC_017814	TTA	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
99	NC_017814	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
100	NC_017814	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
101	NC_017814	CAT	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
102	NC_017814	TTCC	2	8	2897	2904	0 %	50 %	0 %	50 %	386858832
103	NC_017814	ATT	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
104	NC_017814	CTA	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
105	NC_017814	AGT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858832
106	NC_017814	CTG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
107	NC_017814	TTAT	2	8	3025	3032	25 %	75 %	0 %	0 %	386858832
108	NC_017814	CTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
109	NC_017814	TTC	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
110	NC_017814	TCT	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
111	NC_017814	CTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
112	NC_017814	CAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
113	NC_017814	CAT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
114	NC_017814	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
115	NC_017814	T	6	6	3360	3365	0 %	100 %	0 %	0 %	386858832
116	NC_017814	TTC	2	6	3377	3382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
117	NC_017814	CCT	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017814	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017814	TTTA	2	8	3423	3430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017814	A	6	6	3436	3441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017814	TAAA	2	8	3442	3449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017814	TA	3	6	3458	3463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017814	A	7	7	3484	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017814	CT	3	6	3496	3501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017814	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017814	ACA	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858833
127	NC_017814	TC	3	6	3616	3621	0 %	50 %	0 %	50 %	386858833
128	NC_017814	TTAT	2	8	3630	3637	25 %	75 %	0 %	0 %	386858833
129	NC_017814	TAC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
130	NC_017814	CAT	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
131	NC_017814	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858833
132	NC_017814	CTG	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
133	NC_017814	TCTT	2	8	3816	3823	0 %	75 %	0 %	25 %	386858833
134	NC_017814	TAT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858833
135	NC_017814	T	6	6	3857	3862	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
136	NC_017814	CAG	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
137	NC_017814	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
138	NC_017814	CAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
139	NC_017814	AGC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
140	NC_017814	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
141	NC_017814	TGC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
142	NC_017814	CAT	2	6	4012	4017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
143	NC_017814	T	8	8	4046	4053	0 %	100 %	0 %	0 %	386858833
144	NC_017814	AGT	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858833
145	NC_017814	CAC	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858833
146	NC_017814	ATCTT	2	10	4200	4209	20 %	60 %	0 %	20 %	386858833
147	NC_017814	CTT	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
148	NC_017814	CTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
149	NC_017814	CTTA	2	8	4253	4260	25 %	50 %	0 %	25 %	386858833
150	NC_017814	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
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153	NC_017814	TAC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
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158	NC_017814	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017814	T	8	8	4640	4647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017814	A	7	7	4675	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017814	TA	3	6	4689	4694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017814	TA	3	6	4704	4709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017814	TAAAA	2	10	4724	4733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017814	A	6	6	4730	4735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017814	CT	4	8	4749	4756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_017814	TA	4	8	4792	4799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017814	ATTA	2	8	4813	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017814	TTA	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017814	TCTTT	2	10	4863	4872	0 %	80 %	0 %	20 %	386858834
172	NC_017814	T	6	6	4876	4881	0 %	100 %	0 %	0 %	386858834
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180	NC_017814	ATT	2	6	5166	5171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
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286	NC_017814	T	6	6	8008	8013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017814	AGA	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017814	TA	3	6	8054	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017814	AC	3	6	8060	8065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_017814	A	7	7	8081	8087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017814	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858837
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322	NC_017814	CCT	2	6	9963	9968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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327	NC_017814	TAA	2	6	10099	10104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_017814	TTATT	2	10	10181	10190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.